Организация Хеллсинг специализирующаяся на борьбе с нечестью переживает свои самые темные и трудные времена. Алукард потихоньку выходит из-под контроля Интегры, тем самым уничтожает организацию изнутри. Интегра делает все возможное что бы удержать на плаву свое семейное дело жизни. Серас и Бернадотте со своим отрядом "Дикие гуси" остаются последней надеждой Хеллсинга и последней надеждой вернуть рассудок Алукарду. Уолтер разрывается на части на части между двумя организациями Хеллсинг и Мииениум, так и не до конца решив с кем ему быть.
В Ватикане умирает Папа Римский и Энрико Максвелла предлагают на роль Его Преосвященства. Искариот переманивает на свою сторону Андерсона и пытаются взять верх над руководством Хеллсинга.
Миллениум, не на шутку, готовиться к войне. Майор строит грандиозную план-атаку, а Док оживляет Мину и у4совершенствует фриков. А все остальые члены организации, как можно больше, вытягивают информацию из ихних врагов-организаций.